Según Humza Yousaf, las huelgas de médicos en formación causarán "grandes trastornos" en el NHS escocés.
El primer ministro advirtió de que se cancelarán las consultas tras presidir una reunión de ministros y responsables sanitarios para prepararse ante las emergencias.
Los médicos en formación iniciarán una huelga de cuatro días la semana siguiente tras rechazar un aumento salarial del 14 por ciento en dos años.
El procedimiento fue calificado de "último recurso absoluto" por la Asociación Médica Británica (BMA).
El presidente del comité escocés de médicos en formación de la BMA, el Dr. Chris Smith, añadió que los huelguistas desde el miércoles hasta el sábado de la próxima semana estaban "defendiendo el futuro del NHS".
La Scottish Government Resilience Room (SGoRR), que es el equivalente del comité Cobra del Reino Unido, fue convocada por el Sr. Yousaf el lunes.
Con el fin de minimizar el impacto significativo en los pacientes tanto como sea posible, dijo, "Me dieron una actualización de las negociaciones con la BMA y el trabajo que está haciendo el NHS Escocia".
Cualquier cita pospuesta será reprogramada tan pronto como sea posible.
"Sin embargo, debemos ser honestos con el público; una huelga de médicos en formación causaría una interrupción significativa y obligaría al NHS a reducir significativamente la cantidad de tratamiento, cirugía y atención que puede ofrecer. "
La oferta salarial a los médicos en formación, según él, es la más alta desde la devolución en 1999 y la mejor "a bastante distancia" en el Reino Unido.
A la reunión del SGoRR también asistieron representantes del NHS, el director médico, Dr. Sir Gregor Smith, el secretario de Sanidad, Michael Matheson, y la viceprimera ministra, Shona Robison.
Según el Dr. Chris Smith, los médicos en formación de Escocia han declarado en repetidas ocasiones y con vehemencia que las ofertas salariales hechas hasta ahora por el gobierno escocés son insuficientes para mostrar un compromiso para detener los años de erosión salarial que hemos experimentado, lo que ha resultado en reducciones salariales del 28,5% desde 2008. ".
Continuó: "A menos que tomemos medidas inmediatas e invirtamos en el futuro de la fuerza de trabajo, seguiremos perdiendo médicos a países donde se les paga justamente, poniendo en peligro la atención que podemos ofrecer a la gente de Escocia, tanto ahora como en el futuro.
"Es por esto que nos vimos obligados a anunciar las fechas de huelga para finales de este mes, y al hacerlo, dimos a los consejos de salud y al gobierno escocés más tiempo para prepararse. ".
Como parte de las celebraciones por el 75 aniversario del NHS, el Sr. Yousaf también realizó una visita al NHS Forth Valley.
Dio a conocer una inversión adicional de 9 millones de libras en el Programa Transforming Cancer Care, una colaboración para ayudar a los pacientes de cáncer y a sus familias.
Paul O'Kane, portavoz laborista en materia de justicia social, seguridad social y justicia, instó al primer ministro a participar activamente en las negociaciones salariales.
Le dijo a la BBC de Escocia: "Lo que estamos viendo en toda la pieza es que la gente no puede ser retenida dentro del sistema, que no hay ningún incentivo para que se queden, y que están en el punto de ruptura.
No tienen el apoyo que requieren, están estresados, y están quemados.
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